一般感染菜花後，半年內會發作，但也有潛伏2年後，等人體免疫力下降時才發作。感染菜花初期，患部表面會呈現灰白色或淡紅色的微粒，但初次感染者往往不察，隨著時間會逐漸擴散成片狀，尤其會破壞黏膜層和皮膚表面的鱗狀細胞，患者會感覺越來越不舒服，症狀更加劇。感染菜花後，如延誤治療，女性恐菜花蔓延進入陰道，將提高罹患子宮頸癌之風險，男性則有可能引發陰莖癌，後果不堪設想。
西醫治療菜花，主要以雷射電燒、塗抹外部藥物或二氧化氮冷凍，來去除表皮突出物。然而，雷射電療本身會破壞皮膚組織，至於塗抹藥物會有刺痛感，且若像上述案例，菜花長入陰道，也難以塗抹藥物，增加治療困難度。此外，這些治療方法雖能暫時控制住外部生長，不過一旦患者抵抗力下降，病毒又會伺機發威，故門診可見不少患者於接受西醫治療後仍持續復發，無奈地前來求助中醫。
菜花中醫健保，是透過內服加味五寶解毒散，清熱、解毒、消疣，來增加細胞免疫功能，達到治療效果；加上外抹蒲公英、冇骨消的萃取液，治療後能讓菜花病原體自然脫落而愈。不僅可彌補西醫只能去除皮膚表面菜花的不足之處，也可兼顧解毒及提升抵抗力，能將復發機率降到1成以下，但治癒速度與個人體質與生活作息有關。
接受中醫療程期間應禁止與他人有性接觸，注意個人衛生、睡眠充足、適當運動、戒菸戒酒，避免食用辛辣刺激物，才能早日康復。值得注意的是，菜花病毒本身的傳染力極強，即使在潛伏期間未發作，但已具有傳染力，門診中夫妻或性伴侶間相互傳染菜花的情況相當普遍，因此一旦發現感染，伴侶必須一同接受療程，以免一人治癒後又接觸染病的另一半，一再重複感染。